Posts

Updates of Summer Research in Tyumen, Russia

Image
Reverse Order of Dates
The camp
Mosquittos!!
Siberian times reported the mummies newly discovered in Siberia. The cases will be studied by collaboration of Russian and S Korean scientists. 

Siberia Times http://siberiantimes.com/other/others/features/cocooned-in-copper-best-fur-fabric-and-birch-bark-an-adult-and-tiny-baby-from-the-8th-century/
Joseon Ilbo (Korean) http://news.chosun.com/site/data/html_dir/2017/07/17/2017071702176.html
"Researchers from the Centre for Arctic Studies and Seoul National University are working on the finds. Siberian scientists will do tomography tests  to ascertain  the level of body preservation. This will also highlight any burial artifacts hidden inside the cocoons."




Excavation at Chepgul site begins
Eurasian Steppe
West Siberian Plain

Tyumen area
The view of Chepgul Site

Organizing Paleopathology Session in 2018 IPPA Congress

2nd Call for Abstracts

We politely ask you to join in our session proposal for upcoming 2018 IPPA congress. We already had our own paleopathology session in previous 2014 IPPA meeting (“Paleopathology in Asia” session). This session is the update of the studies after then on. Please send your abstract to us if you hope to join in our session.

The Indopacipic Prehistory Association Congress will open on Sunday 23 September and sessions will run on Monday 24, Tuesday 25, Thursday 27 and Friday 28 September, 2018. The venue is Hue, the famous medieval capital city of Vietnam.

Organizers: Drs. Hisashi Fujita (Niigata College of Nursing, Japan) and Dong Hoon Shin (Seoul National University, South Korea)

Session Title: Recent Progress in Paleopathology of Asia

Abstract: Recently, paleopathology has been established in Asia as the indispensable research for revealing ancient people’s health and disease status by studies on the tissues remnant in archaeologically obtained biological specimens…

Paleoparasitology Session in ICOPA 2018

Image
14th International Congress of Parasitology

The official site of the congress....Click Below


CALL FOR PAPERS
We are organizing the "Paleoparasitology session" for upcoming ICOPA 2018 meeting (Aug 19-24, 2018). 
Abstract can be submitted to http://www.icopa2018.org/index.php (The abstract submission will be available in the spring of 2018).
When you will submit the abstract for the paleoparasitology session, please contact one of the people below who are working for the successful organization of this session.
Karl Reinhard: kreinhard1@me.com Min Seo: bbbenji@naver.com Dong Hoon Shin: cuteminjae@gmail.com Alena Iniguez: alenainiguez@gmail.com
We will arrange your invaluable abstract to be presented in our paleoparasitology session. 
*We hope to design the Special Issue of International Journal of Paleopathology with the papers based on the novel abstracts presented in this session. 
-----------------------------------------------------------------------

Organizing 2017 Korea-Japan Paleopathology Forum

Korean Association of Paleopathology and Osteoarchaeology (S Korea) and Japanese Association of Paleopathology will hold the Korea-Japan Paleopathology Forum on October, 2017.

Date: 2017/10/21-22
Venue: Tokyo (University of Tokyo)

Podium Presentations:

Youngjun Kim (Seoul National University): Paleopathology in South Asia

Eun Jin Woo, Hyunwoo Jung, Sunyoung Pak (Yonsei University College of Dentstry): A Probable Case of Venereal Syphilis in Korea (19th Century A.D.)

Min Seo (Dankook University) and Dong Hoon Shin (Seoul National University): Paleopathological review of malaria in pre-modern Korean society

Poster Presentations:

Myeung Ju Kim (Dankook University): Anatomy of the Joseon mummy's heart: the paleopathologcical basis of cardiology

Chang Seok Oh (Seoul National University): First report on the detection of Helicobacter pylori ancient DNA from Korean mummies

Jong Ha Hong (Seoul National University):Ancient DNA analysis on 18s rRNA and ITS2 genes of Trichuris trichiura eggs obtained…

Lecture: Recent Progress in Paleopathology (Graduate)

과목번호: 801.2607 (대학원/의학과_해부학전공과목)
과목명(국문): 고병리학 연구의 최신지견
과목명(영문): Recent Progress in Paleopathology

일시: 매주 화요일 저녁 6시 – 8시 50분
장소: 해부학교실 회의실

책임 교수: 신동훈 (740-8203)
담당 지원: 홍종하 (740-8199)

성적: 출석-20, 과제-20, 기말고사-40, 학습태도-20

1주차: 9/5 오리엔테이션 신동훈

2주차: 9/12 BLAST (1) 신동훈

3주차: 9/19 BLAST (2) 신동훈

4주차: 9/26 BLAST (3) 신동훈

5주차: 10/10 BLAST (4) 오창석/신동훈

6주차: 10/17 MEGA (1) 신동훈

7주차: 10/24 MEGA (2) 오창석/신동훈

8주차: 10/31 중간고사 신동훈

9주차: 11/7 [특강] 얼굴복원의 이론적 기반 이원준/신동훈

10주차: 11/14 Biopython 기초 신동훈

11주차: 11/21 Phylogenetic Network (1) 신동훈

12주차: 11/28 Phylogenetic Network (2) 신동훈

13주차: 12/5 Bayesian inference in phylogeny (1) 신동훈

14주차: 12/12 Bayesian inference in phylogeny (2) 신동훈

15주차: 12/19 기말고사 신동훈

Lecture: June 22, 2017: Fundamentals of Clinical Neuroanatomy

Image
아래에 질문이나 제안 사항 적어주시기 바랍니다.
강의 기간 동안 수고들 많으셨습니다.

---------------------------------------------------------------
아래 학생 질문에 대한 답입니다. 조교선생님들이 한번 더 공식적으로 공지 할 것입니다.

문) 오늘 설명하셨던 sensory tract부분에 대해 신경생리학 부분과 충돌 된다고 생각하는 것이 있어 질문올립니다!
Spinothalamic pathway: pain, temperature, light touch, pressure
Medial lemniscus system: discrimitive tactile sensation, vibration
각각의 tract가 담당하는 감각의 종류를 오늘의 강의에서는 위와 같이 분류해 놓았는데 신경생리학 체성감각 파트에서는 touch와 pressure에 대한 분류가 다르게 되어있어 혼동이 되었습니다.
신경생리학 강의에서의 분류는 다음과 같습니다.
Dorsal column-medial lemniscal pathway: '촉각', '압각', 진동감각, 고유감각, 두점식별
Spinothalamic pathway: 통각, 온각, 냉각
Brown-squard syndrome과 같이 infarction이 왔을 때 두 가지 감각의 분류가 어디로 들어가냐에 따라서 영향을 받는 곳에 대한 답이 다르게 나올 수 있다고 생각하여 통일하는 과정이 필요하다고 생각하였습니다.

답) 타당한 질문이며 생리학 교실 강의 내용을 함께 검토하여 우리 강의에서도 spinothalamic tract와 medial lemniscus system의 기능에 대해서는 아래 생리학 교실 강의에서 다룬 내용에 맞추어 통일 하도록 하겠습니다. 아래 슬라이드는 생리학 강의에서 이미 보셨지요? 기능에 대해서는 이에 준하여 이해해 주시기를 부탁합니다.




--------------------------------------------------------…

Open Journal Club: R and Python for Anatomists and Anthropologists

Open Journal Club:
R and Python for Anatomists and Anthropologists

Chaired by Shin DH
(Dpt of Anatomy and Cell Biology, Seoul National Univ. College of Medicine)

-----------------------------------------------------------
2017/6/28

1) t-test (Welch's and pooled variance)
1a) t-test and Z-test
2) 등분산검정 (Testing the equality of two variances)
3) box plot
4) strip chart
5) par(mfrow) function
6) Central limit theorem
7) 모수적 방법(parameteric method) 과 비모수적 방법 (non-parameteric method)

발표: 홍종하 (해부, 생물인류학 및 고병리학)
Data set: 홍종하 제공
Code: 홍종하 제공

일시: 6월 28일 (수) 오후 6시 (1시간 예정)
장소: 해부학교실 회의실

피자 1쪽 무료 선착순 제공
콜라 등 음료수 각자 지참

준비물: R이 설치된 랩탑
(반드시 미리 R 설치해 올 것)

Lecture: June 20, 2017: Cerebellum & Functional localization in the cerebral cortex and pathways of brainstem

6월 20일 보강 관련입니다.
질문 있으신 분들 아래에 써 주세요.
이제 얼마 남지 않았습니다. 모두들 힘 내시고요.

Lecture: June 14, 2017: Cerebral White Matter; Limbic System

6월 14일 강의한 Cerebral White Matter 및 Limbic system 부분입니다.  아래에 질문을 올려주시기 바랍니다.
*강의록에 cingulum과 parahippocampal gyrus가 혼란스럽게 그림이 올라 있어 아래 그림을 참고하시기 바랍니다.
Cingulum과 Parahippocampal gyrus의 관계 (클릭)


Lecture: June 14, 2017: Introduction to BLAST (Graduate)

In this lesson, you will learn to use BLAST in NCBI.  This class is for graduate students, Seoul National University Graduate School. 
강의 시작 전 다음 사항을 준비하시기 바랍니다. 
1. 랩탑 (어떤 기종이든 무관합니다)
수업은 다음 순서로 진행 합니다. 
1. BLAST 사용법 개관 2. 제공 된 서열로 관련 유전 정보 검색하는 법
*강의 내용에 대한 질문은 아래에 댓글로 달아주시기 바랍니다.  **조교선생은 강의실 인터넷 연결 상황을 미리 점검하시기 바랍니다.  ***수업시간 내에 못마쳐 넘치는 강의 내용은 과제로 부과할 것입니다.

Lecture: June 13: Corpus Striatum

아래에 질문을 올려주시면 되겠습니다. 

Lecture: June 7, 2017: Warming Up_Brain

강의시간 질문은 아래에 하시기 바랍니다. 

Lecture: Statistics with R (Graduate)

Image
In this lesson, you will learn to use R to perform basic statistical works on the dataset.
This class is for graduate students, Seoul National University Graduate School.

강의 시작 전 다음 사항을 준비하시기 바랍니다.

1. 랩탑 (어떤 기종이든 무관합니다)
2. 강의 핸드아웃 (학교앞 복사집에 맡겨 놓았으니 각자 카피를 찾아서 수업에 들어오시기 바랍니다)
3. Dataset (제가 제공해 드릴것입니다)

수업은 다음 순서로 진행 합니다.

1. R 설치
2. 활용 실습 (기술통계량, 상자그림, 히스토그램, 그래프 그리기)
3. t-test
4. ANOVA
5. R graphics

*강의 내용에 대한 질문은 아래에 댓글로 달아주시기 바랍니다.
**조교선생은 강의실 인터넷 연결 상황을 미리 점검하시기 바랍니다.
***수업시간 내에 못마쳐 넘치는 강의 내용은 과제로 부과할 것입니다.